國立澎湖科技大學前身為國立高雄海專澎湖分部於民國80年成立,84年正式獨立設為國立澎湖海事管理專科學校,89年升格為國立澎湖技術學院,至94年 正式改制為科技大學。
本校設有人文暨管理、觀光休閒及海洋資源暨工程等三個學院,共有12個系,5個研究所以及共同教育委員會(下設通識教育中心及基礎能力教學中心), 為台灣海峽上第一所大學亦是唯一一所離島形態的科技大學,為國家培養海洋漁業、觀光休閒、科技及管理的各種人才,不僅提供澎湖在地人才培訓機會, 拉近與台灣本島之教育落差,也對當地產業、經濟與文化之提升有直接貢獻。