在行政單位,設有人事室、秘書室、主計室、教務處、學務處、總務處、研究發展處、圖書資訊館以及進修推廣部。 教務處下設單位:註冊組、課務組及教學資源中心。 學務處下設單位:生活輔導組、體育運動組、課外活動指導組及身心健康中心。 總務處下設單位:文書組、事務組、出納組、營繕組、保管組及環安組。 研究發展處下設單位:企劃研究組、實習就業輔導組、島嶼產業科技創新育成中心及箱網養殖業技術研發中心。 圖書資訊館下設單位:圖書資源組、資訊服務組及藝文中心。